Primera versión del genoma de la soja

Los estudios que arrancaron en el año 2006 completándose a principios de 2008, fueron iniciados en el Joint Genome Institute del Departamento de Energía de EEUU que tiene interés en la aplicación del aceite de soja para la producción de biodiésel. Según el Censo 2007, en EEUU el 80% del biodiésel se elaboraría a partir de este aceite. Las cabezas del consorcio de investigadores fueron Gary Stacey, Randy Shoemaker, Scott Jackson, Jeremy Schmutz y Dan Rokhsar.

Se identificaron 66.153 loci de codificación de proteínas. Se entiende que esta cantidad representaría el 98% de los genes codificantes de proteínas del genoma.

La versión difundida del genoma denominada Glyma1 fue realizada por Jeremy Schmutz en el Centro JGI del Genoma Humano de Stanford usando el ensamblador Arachne2 adaptado a las características muy repetitivas del genoma de la soja. Se ha encontrado que el genoma de la soja tiene más genes que la especie humana, pero de manera más repetitiva. Los humanos tienen unos 25.000 genes pero con pocas repeticiones.

Lo que se ha hecho es establecer la secuencia de genes y ahora viene la parte más útil que es encontrar para que sirve cada uno de ellos. De tal manera que se abre una puerta de gran significación a la mejora de la especie, ya que hasta ahora se cruzaban individuos que mostraban ciertas características fenológicas de interés, mientras que a partir del pleno conocimiento de la actividad de los genes se cruzarán los individuos que cuenten con genes perfectamente identificados que se desea multiplicar. Para valorar este avance científico, debe tenerse en cuenta que la soja ofrece el 70% de la proteína consumida en el mundo.

Referencia: Phytozome

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